山阴海岸国立公园的断崖、海蚀洞、砂丘和礁石为各种各样的生物提供了天然的栖息地。筛草、圆叶蔓荆及肾叶打碗花等植物在鸟取砂丘与丹后砂丘上茁壮生长。海兔以及节庆多彩海麒麟等海蛞蝓则栖息于公园的水域内。公园各处还生活着各种哺乳动物，例如梅花鹿、野猪和貉。
植物
洞庭蓝
洞庭蓝（学名：Pseudolysimachion oruatum）是一种生长在日本海沿岸的多年生植物。每年 8 月至 9 月，它会绽放出紫色的小花。在山阴海岸国立公园的丹后砂丘，随处可见洞庭蓝的身影。
洞庭蓝
肾叶打碗花
肾叶打碗花（学名：Calystegia soldanella）是一种生长在海滨沙地及湖滨区域的多年生藤本植物。每年 5 月至 6 月，山阴海岸国立公园的肾叶打碗花会开出喇叭状的粉红色花朵。
肾叶打碗花的喇叭状花朵
动物
东方白鹳
东方白鹳（学名：Ciconia boyciana）通常栖息于湿地。它们以小型生物为食，例如鱼、青蛙、蛇和蚱蜢。东方白鹳曾一度在日本野外销声匿迹，后经重新引进，现栖息于圆山川附近。
东方白鹳
节庆多彩海麒麟
节庆多彩海麒麟（学名：Hypselodoris festiva）属于海蛞蝓，栖息于潮池和礁石之中。它们的身体呈深蓝色，并带有亮黄色的斑点和条纹。这种软体动物通常以海绵为食。
色彩斑斓的节庆多彩海麒麟